Молекулярная идентификация байкальских рыбьих пиявок
| Авторы: | И. А. Кайгородова, Е. Ю. Петряева |
| Аннотация: | Сравнение нуклеотидных последовательностей маркерных фрагментов гена первой субъединицы митохондриальной цитохром С оксидазы байкальских эндемичных рыбьих пиявок и филогенетически близких им палеарктических видов показал, что байкальские виды имеют уникальные последовательности ДНК, накопившие в ходе эволюции достаточное количество нуклеотидных замен для идентификации видового статуса этих пиявок. Кроме того, вид, обитающий в р. Ангаре, имеет значительное генетическое расстояние от байкальского собрата, что ставит под сомнение его видовую принадлежность. |
| Ключевые слова: | молекулярный анализ, ДНК-штрихкодирование, Piscicolidae, Байкал |
| УДК: | 575.86, 595.143.2 |
| Литература: |
1. Догель В. А. Паразитофауна рыб Байкала / В. А. Догель, И. И. Боголепова // Тр. Байкал. лимнол. станции. – 1957. – № 15. – С. 446–452. 2. Лукин Е. И. Пиявки пресных и соленоватых водоемов / Е. И. Лукин // Фауна СССР. Пиявки / АН СССР. Зоол. ин-т. – 1976. – Т. 1. – С. 1–484. 3. Шнеер В. С. ДНК-штрихкодирование видов животных и растений – способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия // Журн. общ. биологии. – 2009. – Т. 70, № 4. – С. 296–315. 4. Эпштейн В. М. Annelida / В. М. Эпштейн // Определитель паразитов пресноводных рыб фауны СССР / под ред. О. Н. Бауер. – 1987. – Т. 3, ч. 2. – С. 340–372. 5. Basic local alignment search tool / S. Altschul [et al.] // J. Mol. Biol. – 1990. – Vol. 215. – P. 403–410. 6. Biological identifications through DNA barcodes / P. Hebert [et al.] // Proc. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. – 2003. – Vol. 270, N 1512. – P. 313–321. 7. Clustal W and Clustal X version 2.0 / M. Larkin [et al.] // Bioinformatics. – 2007. – Vol. 23. – P. 2947–2948. 8. DNA primer for amplification of mitochondrial cytochrom c oxidase subunit from diverse metazoan invertebrates / O. Folmer [et al.] // Mol. Mar. Biol. Biotech. – 1994. – Vol. 3. – P. 294–299. 9. Doyle J. Preservation of plant samples for DNA restriction endonuclease analysis / J. Doyle, E. Dickson // Taxon. – 1987. – Vol. 36. – P. 715–722. 10. Huson D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies / D. Huson, D. Bryant // Mol. Biol. Evol. – 2006. – Vol. 23, N 2. – P. 254–267. 11. Kaygorodova I. A. A revised checklist of the Lake Baikal leech fauna // Lauterbornia. – 2012. – Vol. 75. – P. 49–62. 12. Kaygorodova I. A. An illustrated checklist of leech species from Lake Baikal (East Siberia, Russia) / I. A. Kaygorodova // Dataset Papers in Zoology. – 2013. – Vol. 2013. – P. 1–4. 13. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony method / K. Tamura [et al.] // Molecular Biology and Evolution. – 2011. – Vol. 28. – P. 2731–2739. 14. New algorithms and methods to estimate maximum-likelihood phylogenies: assessing the performance of PhyML 3.0 / S. Guindon [et al.] // Systematic Biology. – 2010. – Vol. 59, N 3. – P. 307–321. |