«Биология. Экология» 2014 7

Анализ структуры и характеристика комбинационного разнообразия видовых ассоциаций лактобацилл вагинального биотопа

Авторы: Н. М. Шабанова, Ю. П. Джиоев, С. М. Попкова, П. А. Медведева, И. Н. Данусевич, Г. В. Юринова, В. П. Саловарова
Аннотация:

С помощью ПЦР-диагностики проведена идентификация видов лактобацилл, вегетирующих в вагинальном биотопе женщин с неспецифическими воспалительными заболеваниями нижнего этажа полового тракта. Оценка комбинационного разнообразия проведена по пяти видам. Установлено превалирование двух видов из пяти определяемых – L. plantarum и L. crispatus. Разработаны количественные параметры (коэффициенты) оценки комбинационного разнообразия видовых ассоциации. На основе предложенных коэффициентов для оценки степени парной совместимости видов определены доминирующие ассоциации видов лактобацилл.
Ключевые слова: полимеразная цепная реакция (ПЦР), лактобациллы, геновидовая идентификация, комбинации видов, коэффициент сходства (совместимости) видов, коэффициент комбинационного разнообразия видовых ассоциаций
УДК: 616-008.87-07.097.931
Литература: 1. Акушерство: национальное руководство / ред. Э. К. Айламазян [и др.] – М. : ГЭОТАР-Медиа, 2007. – 1200 с.
2. Бондаренко В. М. Молекулярно-генетические и молекулярно-биологические исследования представителей родов Bifidobacterium и Lactobacillus / В. М. Бондаренко // Вестн. РАМН. – 2006. – № 1. – С. 18–23.
3. Гайдашев И. П. Анализ и обработка данных. Специальный справочник / И. П. Гайдашев. – СПб. : Питер, 2001. – 750 с.
4. Гарден А. С. Детская и подростковая гинекология / А. С. Гарден. – М. : Медицина, 2001. – 238 с.
5. Глушанова Н. А. Биологические свойства лактобацилл / Н. А. Глушанова // Бюл. сиб. медицины. – 2003. – № 4. – С. 50–58.
6. Микроэкология влагалища. Коррекция микрофлоры при вагинальных дисбактериозах / В. М. Коршунов [и др.]. – М. : ВУНМЦ Минздрава РФ, 1999. – 80 с.
7. Муравьева В. В. Микробиологическая диагностика бактериального вагиноза у женщин репродуктивного возраста : автореф. дис. ... канд. биол. наук / В. В. Муравьева. – М., 1997. – 23 с.
8. Одум Ю. Экология : в 2 т. / пер. с англ. Ю. М. Фролова ; под ред. В. Е. Соколова. – М. : Мир, – 1975. – 740 с.
9. Особенности нормальной микрофлоры влагалища у девочек дошкольного возраста / А. С. Анкирская [и др.] // Микробиология. – 2004. – Т. 4. – С. 54–58.
10. ПЦР в реальном времени [Электронный ресурс]. – URL: http://www.ld.ru/catalog/rts/pcr/realtime-pcr.html.
11. Соловьева А. В. Характеристика влагалища в норме и патологии : автореф. дис. … канд. мед. наук / А. В. Соловьева. – М., 1987. – 165 с.
12. Структура видового разнообразия лактобацилл из вагинального биотопа женщин, проживающих в г. Иркутске / П. А. Медведева [и др.] // Изв. Иркут. гос. ун-та. Сер. Биология. Экология. – 2012. – Т. 5, № 1. – С. 11–19.
13. Association between Lactobacillus species and bacterial vaginosis-related bacteria, and bacterial vaginosis scores in pregnant Japanese women / R. Tamrakar [et al.] // BMC Infectious Diseases. – 2007. – Vol. 7, Iss. 1. – P. 128. – URL: http://www.biomedcentral.com/1471-2334/7/128.
14. Gilbert J. A. Modeling the Earth Microbiome / J. A. Gilbert, F. Meyer // Mi-crobe. – 2012. – N 7. – P. 64–69.
15. Lee Y-K. Effects of diet on gut microbiota profile and the implications for health and disease / Y-K. Lee // Bioscience of Microbiota, Food and Health. – 2013. – Vol. 32, N 1. – P. 1–12.
16. Onderdonk A. B. Normal vaginal microflora / A. B. Onderdonk, K. W. Wissemann // Vulvovaginitis. – N.Y. : Basel-Hong Kong, 1993. – P. 285–303.
17. Quadri L. E. Regulation of antimicrobial peptide production by autoinducer-mediated quorum sensing in lactic acid bacteria / L. E. Quardi // Antonie Van Leeuwenhoek. – 2002. – N 82 (1–4). – P.133–145.
18. The NIH Human Microbiome Project / NIH HMP Working Group [et al.] // Genome Research. – 2009. – N 19. – P. 2317–2323.
19. Vaginal microbiota and the use of probiotics / S. Cribby [et al.] // Interdiscipli-nary perspectives on infectious diseases. – 2008. – Vol. 2008. – 9 p.