«Биология. Экология» 2012 3

Генетическое разнообразие цианофагов семейства Myoviridae в озере Байкал

Авторы: Т. В. Бутина, С. А. Потапов, О. И. Белых, Н. Дамдинсурэн, Б. Чойдаш
Аннотация:

Высокое генетическое разнообразие цианофагов семейства Myoviridae в оз. Байкал выявлено на основе анализа генов капсидного белка g20. Наибольшее сходство проанализированных фрагментов установлено с генами вирусов, поражающих цианобактерии Synechococcus sp., и с генами некультивированных пресноводных бактериофагов.
Ключевые слова: цианофаги, семейство Myoviridae, генетическое разнообразие, ген g20, оз. Байкал
УДК: 578.816(282.256.341)
Литература: 1. Белых О. И. Выявление и учёт вирусоподобных частиц в байкальской воде с помощью эпифлуоресцентной микроскопии / О. И. Белых, С. И. Беликов // Третья Верещагин. Байкал. конф. : тез. докл. – Иркутск, 2000. – С. 27.
2. Бутина Т. В. Молекулярно-генетическая идентификация Т4-бактериофагов в озере Байкал / Т. В. Бутина, О. И. Белых, С. И. Беликов // Докл. Акад. наук. – 2010. – № 433. – С. 406–409.
3. Дрюккер В. В. Бактериофаги как новое трофическое звено в экосистеме глубоководного озера Байкал / В. В. Дрюккер, Н. В. Дутова // Докл. Акад. наук. – 2009. –Т. 427. – С. 277–281.
4. Belykh O. I. Autotrophic picoplankon of Lake Baikal: species composition, abundance and distribution / O. I. Belykh and E. G. Sorokovikova // Aquat. Ecosyst. Health Manag. – 2003. – Vol. 6. –P. 251–262. 5. Characteristics of Lake Baikal summer phytoplankton and autotrophic picoplankton / O. I. Belykh [et al.] // Inter. J. Algae. – 2007. –Vol. 9. –P. 247–263.
6. Dorigo U. Cyanophage diversity, inferred from g20 gene analyses, in the largest natural lake in France, Lake Bourget / U. Dorigo, S. Jacquet and J. F. Humbert // Appl. Environ. Microbiol. – 2004. – Vol. 70. – P. 1017–1022.
7. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/ NT / T. A. Hall // Nucl. AcidsSymp. Ser. – 1999. – Vol. 41. – P. 95–98.
8. Huelsenbeck J. P. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees / J. P. Huelsenbeck and F. Ronquist // Bioinformatics. – 2001. – Vol. 17. – P. 754–755.
9. Mann N. H. Phages of the marine cyanobacterialpicophytoplankton / N. H. Mann // FEMS Microbiol. Reviews. – 2003. – Vol. 27. – P. 17–34.
10. Marine and Freshwater Cyanophages in a Laurentian Great Lake: Evidence from Infectivity Assays and Molecular Analyses of g20 Genes / S. W. Wilhelm [et al.] // Appl. environ. microbiol. – 2006. – Vol. 72. – P. 4957–4963.
11. Marston M. F. Genetic diversity and temporal variation in the cyanophage community infecting marine Synechococcus species in Rhode Island’s coastal waters / M. F. Marston and J. L. Sallee // Appl. environ. microbiol. – 2003. – Vol. 69. – N 8. – P. 4639–4647.
12. Millard A. D. A temporal and spatial investigation of cyanophage abundance in the Gulf of Aqaba, Red Sea / A. D. Millard and N. H. Mann // J. Mar. Biol. Assoc. – 2006. – Vol. 86. – P. 507–515.
13. Occurrence of a sequence in marine cyanophages similar to that of T4 g20 and its application to PCR-based detection and quantification techniques / N. J. Fuller [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. – 1998. – Vol. 64. – P. 2051–2060.
14. Phylogenetic diversity of marine cyanophage isolates and natural virus communities as revealed by sequences of viral capsid assembly protein gene g20 / Y. Zhong [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. – 2002. – Vol. 68. – P. 1576–1584.
15. Phylogenetic diversity of T4-like bacteriophages in Lake Baikal, East Siberia / T. V. Butina, O. I. Belykh, S. Y. Maksimenko, S. I. Belikov // FEMS Microbiol. Lett. – 2010. – Vol. 309. – P. 122–129.
16. Portal protein diversity and phage ecology / M. B. Sullivan [et al.] // Environ. Microbiol. –2008. – Vol. 10. – P. 2810–2823.
17. Short C. M. Nearly identical bacteriophage structural gene sequences are widely distributed in both marine and freshwater environments / C. M. Short and C. A. Suttle // Appl. Environ. Microbiol. – 2005. – Vol. 71. – P. 480–486.
18. Sullivan M. B. Cyanophages infecting the oceanic cyanobacterium Prochlorococcus / M. B. Sullivan, J. B. Waterbury and S. W. Chisholm // Nature. – 2003. –Vol. 424. – P. 1047–1051.
19. Suttle C. A. Marine cyanophages infecting oceanic and coastal strains of Synechococcus– abundance, morphology, cross-infectivity and growth characteristics / C. A. Suttle and A. M. Chan // Mar. Ecol. Prog. Ser. – 1993. – Vol. 92. – P. 99–109.
20. Unique viral capsid assembly protein gene (g20) of cyanophages in the floodwater of a Japanese paddy field / G. Wang [et al.] // Biol. Fertil. Soils. – 2010. – Vol. 46. – P. 93–102.
21. Wang K. Prevalence of highly host-specific cyanophages in the estuarine environment / K. Wang and F. Chen // Environ. Microbiol. – 2008. – Vol. 10. – № 2. – P. 300–312.